文章摘要
引用本文:孔 薇,张 昕,牟晓阳.阿尔茨海默症miRNA靶基因预测研究[J].福州大学学报(自然科学版),2015,43(6):851~858
阿尔茨海默症miRNA靶基因预测研究
Target genes prediction for miRNA in Alzheimer’s disease
  
DOI:10.7631/issn.1000-2243.2015.06.0851
中文关键词: 微小RNA  阿尔茨海默症  靶基因  预测  HCTarget算法
英文关键词: mircoRNA  Alzheimer’s disease  target gene  prediction  HCTarget algorithm
基金项目:
作者单位
孔 薇 上海海事大学信息工程学院上海 201306 
张 昕 上海海事大学信息工程学院上海 201306 
牟晓阳 美国罗文大学生物化学系新泽西 08028 
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中文摘要:
      为深入了解阿尔茨海默症的发病机制,利用匹配的基因表达数据和miRNA表达数据,对miRNA的靶基因进行预测分析. 首先对选择出的差异表达miRNA进行靶基因预测;然后利用HCTarget算法验证预测的靶基因;最后对miRNA及其靶基因构建调控网络. 调控网络中包含11个已确定的与AD有关的miRNA及6个AD致病基因. 通过分析网络发现miRNA及其靶基因在正常与患病两种情况下的活性变化趋势,生物学分析也证实了它们在AD中的重要作用,为AD发病机制研究提供了依据.
英文摘要:
      The research of miRNAs will help to further understand the pathogenesis of Alzheimer’s disease. In this paper,we use matching gene expression data and the miRNA expression data to estimate and analyze the miRNAs’ target genes. First we estimate the target genes of the chosen differentially expressed miRNAs. Then we use HCTarget algorithm to validate the forecast target genes. At last we built regulation network of miRNAs and its target genes. The regulation network contains 11 identified miRNAs associated with AD and 6 AD disease-causing genes. By analyzing the network we found the miRNAs and its target genes’ active trend in two cases of AD: normal and disease,biological analysis also confirmed their important role in the AD,this provided the basis for the research of the pathogenesis of AD.
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